柠檬酸发酵过程中污染青霉菌的原因可以归纳为以下几点：
一、原料与辅料污染
原材料和辅料如果在采购、储存或预处理过程中受到污染，就可能将青霉菌等微生物引入发酵系统。例如，薯干粉、淀粉粕等农副产品如果储存不当，很容易受潮发霉，从而成为污染源。
二、设备与环境污染
发酵罐、管道和其他相关设备如果清洗不彻底或存在卫生死角，就可能残留有青霉菌等微生物。
发酵车间或储存环境的空气洁净度不够，也可能导致青霉菌通过空气传播进入发酵系统。
三、操作污染
操作人员在发酵过程中的无菌操作不规范，如未穿戴洁净的工作服、手套或口罩，或者在操作过程中接触了污染源，都可能将青霉菌等微生物带入发酵液中。
四、空气过滤不当
柠檬酸发酵是好氧发酵，需要持续通风。如果空气过滤系统不完善或者过滤材料未及时更换，就可能导致空气中的青霉菌等微生物进入发酵罐。
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